Phénome du rat

[Nebula]

Lors de mes diverses pérégrinations sur les tumeurs mammaires, je suis tombée sur ça

C'est un projet de phénome du rat.
Dans un premier temps, ils récupèrent des souches/lignées de rats des différents labo. Celles-ci ont des particularités, par exemple elles donnent des rats super-émotifs, et sont utilisées dans des contextes spécifiques (ici, une étude comportementale). L'organisme a pour but de préserver ces lignées des pathogènes, de cryogéniser des embryons ou de conserver des gamètes. Du coup, ils ont des rats bien sous tout rapport, sauf pour une caractéristique précise.

Ils ont aussi des rats "contrôles" ou "témoins", ceux-ci n'ont absolument rien, et sont en très bonne santé. Ce sont notamment des rats issus des souches Wistar ou Sprague-Dawley. (il y a possibilité d'en commander, mais vu le prix des frais de port... ça donne pas envie).

On peut chercher des souches selon plusieurs critères : http://www.anim.med.kyoto-u.ac.jp/NBR/strains/Strains_list.aspx
Attention ! Quand on clique sur une souche (= strain), on a la photo du rat, et la photo de ses organes étalés sur une plaque. Âmes sensibles s'abstenir, c'est dégueu et choquant si on a pas l'habitude.

Bref, l'intérêt de tout ça pour nous, gentils amateurs de rats qui se cultivent.
D'abord comprendre de quels rats on parle dans les articles. Souvent ils utilisent juste leur référence, donc on peut pas savoir si c'est un rat spécifiquement sensible au cancer ou aux AVC.
Ensuite, réussir à démêler les méli-mélos génétiques. Parce qu'à gauche de la photo du rat, on trouve son génotype spécifique à son marquage, sa couleur, sa dilution...
C'est ainsi qu'on peut trouver des rats chocolats, siamois, ou PED (pink eye dilute)... Avec des marquages hooded, irish, berkshire, uni.

Le chocolat de l'exemple est : a,b,C,H  et il est uni, semblerait-il. Un albinos sera noté juste (c), ce qui laisse penser que C est le gène responsable de l'albinisme... Et en trainant j'ai remarqué qu'un hooded est noté [...], h.

Bref, ça peut être intéressant comme lien, donc je partage.

Pour les fan de souris, y a le même genre de site, en beaucoup plus abouti qui existe : http://phenome.jax.org/

[Senalina]

Génial ce truc! 

[lolotte]

ah ui Nebula , les lettres des gènes faut utiliser lesquels ? parce que entre les anglais et les sites francophones, c'est boulgui boulga... Il y a une "nomenclature"  sur laquelle on peut se figer ?

La visiblement ils en utilisent d'autres ou c'est moi ?


Si y'a besoin d'investir et que le projet tient debout, je suis d'accord pour sortir des biftons :p

[Nebula]

Ah c'est un projet japonais, donc peut être une autre nomenclature..?

Je sais pas du tout comment c'est noté en français ou en anglais/américain.

En même temps c'est un projet à visée internationale (j'ai vu que l'institut pasteur leur avait envoyé une lignée à conserver), alors peut être que c'est ce qui est utilisé dans la communauté scientifique ?
Mais tant que personne n'a publié, chacun est libre d'utiliser les lettres qu'il veut. Faut vraiment trouver les articles correspondants... En plus du super article japonais que j'ai perdu le lien, mais qui parlait de quelques marquages, couleurs, et pelages. Ils avaient même du satin, mais c'est parce qu'ils avaient pris les rats des USA côte ouest.

[lolotte]

pourtant y'en a en australie 

[Nebula]

Oui mais géographiquement, la côte ouest des USA, c'est plus proche que l'Australie

[lolotte]

ah merde 

* et paf dans la gueule  :'( *